1998年4月原电子工程系并入信息工程学院。
航海学院设有航海技术和海事管理两个专业。航海技术专业在国内外享有较高的知名度，是1953年并校时保留并进一步发展起来的重点专业，1992年被列为交通部"八五"首批重点建设学科专业。该专业支持交通信息工程和载运工具运用工程两个学科，这两个学科均具有博士和硕士学位授予权。目前，学院已形成博士、硕士、本科及成人教育等多层次、多方式的办学体系。日校以培养硕士研究生和本科生为主，并招收本科、硕士留学生；成人教育则兼办函授、夜大、国内外高级船员培训班、高级海事管理人员培训班，并为其他院校代培进修人员等。在校学生人数达2000余人。
航海学院师资力量雄厚，具有教授、副教授高级专业技术职称的人员占教师总数一半以上。学院拥有6个教研室、4个实验室。在129名教职工中有专任教师95人，其中教授10人、副教授40人、讲师41人、实验技术人员17人，专任教师中有22人持有符合国际船员培训发证值班标准的船长证书或高级船长证书，21人持有大副证书。形成了以国内外航海界知名度高、影响大、学术造诣深的教授为带头人，以具有博士、硕士学位的中青年骨干教师为主力的多支学术梯队，以具有博士、硕士学位的中青年骨干教师为主力的多支学术梯队，并经常参与国内外学术交流，有的教师被聘为国际海事组织的专家顾问。
学院办学条件优越，有能够满足各门专业课教学需要的实验室，如导航、电航仪器、航海、气象、航海模拟器、天象馆等先进的实验室，可供培养适应现代化船舶驾驶与管理的高级航海技术人才之用，也可供广大教师、高年级本科生、研究生进行科学研究。各专业课程均设有专业教室，配有现代化教学设备和教学软件。
学院有较强的科研能力，主要研究方向是：交通信息工程及控制系统、交通运输安全保障与防护技术、载运工具运行安全理论与技术、载运工具运行环境分析与保护等。近年来承担国家自然科学基金、交通部部属单位及学校委托的项目，多项研究成果处于国内领先或达到国际先进水平，并获得省部级科技进步奖，为我国航海科技水平的提高做出了重要贡献。
航海学院除承担本科生教学任务与科学研究工作外，还承担世界海事大学大连分校的教学任务，并根据国际海事组织(IMO)的标准，为国内外培训在职船长和驾驶员，以及进行适任证书评估、考试、培训等。
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